Архив
Редакция журнала «Вестник МГТУ» поддерживает политику открытого доступа «Open Access», что позволяет пользователям бесплатно и неограниченно использовать тексты научных статей (читать, загружать, копировать, распространять) при условии указания авторства.
Фоменко В. В., Большев Н. А., Машенцева Н. Г., Детинкин И. А., Алексаночкин Д. И.
Исследование взаимодействия биологически активных пептидов из сои с молекулами АПФ и ДПП-4 методом молекулярного докинга
DOI: 10.21443/1560-9278-2026-29-3-361-376
Аннотация. Методом молекулярного докинга оценена ингибирующая активность двух биологически активных пептидов соевого происхождения (IIVVQGKGAIGF и VIPPGVPYWTYNT) в отношении ангиотензинпревращающего фермента (АПФ) и дипептидилпептидазы-4 (ДПП-4). В качестве эталонов сравнения использованы синтетические препараты каптоприл и ситаглиптин. Трехмерные структуры пептидов предсказаны с помощью веб-сервера PEP-FOLD4, процедура докинга выполнена в программе AutoDock Vina на основе кристаллических структур из базы PDB (коды 1O86 и 1X70). Результаты показали, что оба пептида демонстрируют статистически значимо более высокую аффинность к АПФ (от –9,07 до –10,46 ккал/моль) по сравнению с каптоприлом (–5,40 ккал/моль). В случае ДПП-4 пептид VIPPGVPYWTYNT превзошел ситаглиптин (–8,56 против –7,86 ккал/моль), тогда как IIVVQGKGAIGF уступил референсу по энергии связывания. Анализ межмолекулярных взаимодействий выявил образование множественных связей с ключевыми остатками активных центров, однако лишь часть контактов локализованы непосредственно в каталитической зоне, что указывает на высокую общую аффинность при потенциально меньшей селективности по сравнению с синтетическими аналогами. Полученные in silico данные подтверждают высокий терапевтический потенциал исследуемых пептидов и обосновывают необходимость их химического синтеза и дальнейшей экспериментальной проверки in vitro и in vivo.
Печатная ссылка: Исследование взаимодействия биологически активных пептидов из сои с молекулами АПФ и ДПП-4 методом молекулярного докинга / В. Фоменко, Н. Большев, Н. Машенцева, И. Детинкин, Д. Алексаночкин // Вестник МГТУ. 2026. Т. 29, № 3. C. 361-376.
Электронная ссылка: Исследование взаимодействия биологически активных пептидов из сои с молекулами АПФ и ДПП-4 методом молекулярного докинга / В. Фоменко, Н. Большев, Н. Машенцева, И. Детинкин, Д. Алексаночкин // Вестник МГТУ. 2026. Т. 29, № 3. C. 361-376. URL: https://vestnik.mauniver.ru/v29_3_n109/04_Fomenko_361-376.pdf.
(на русск., cтр.16, рис. 7, табл 3, ссылок 31, AdobePDF)
